随着亚冠16强的产生，亚冠淘汰赛的赛程也随之出炉。1/8决赛将于9月13日开打，决赛两回合分别在11月21、27日进行。在东亚大区中，有3场日韩PK，卫冕冠军蔚山现代与川崎前锋的对话格外引人关注。在西亚大区中，有2场沙特与伊朗球会之间的交手，沙迦与阿布扎比统一展开阿联酋德比。
东亚大区5个小组，FGI三个组的小组第2获得出线权。根据规程，东亚大区的1/8决赛对阵如下：F1 VS I1、G1 VS I2、H1 VS F2、J1 VS G2，即：
蔚山现代（韩国）VS川崎前锋（日本）
名古屋鲸（日本）VS大邱FC（韩国）
全北现代（韩国）VS BG巴吞联（泰国）
大阪樱花（日本）VS浦项制铁（韩国）
西亚大区5个小组，ABE三个组的小组第2获得出线权。根据规程，西亚大区的1/8决赛对阵如下：A1 VS E1、B1 VS E2、C1 VS A2、D1 VS B2，即：
伊提洛尔（塔吉克）VS波斯波利斯（伊朗）
沙迦（阿联酋）VS阿布扎比统一（阿联酋）
德黑兰独立（伊朗）VS利雅得新月（沙特）
利雅得胜利（沙特）VS大不里士拖拉机（伊朗）
2021赛季亚冠联赛1/8决赛定于9月13日至15日进行（西亚9月13日-14日，东亚9月14日-15日），采用单场决胜制。1/4决赛于9月27日至29日进行（西亚9月27日-28日，东亚9月28日-29日），仍为单场淘汰制。
自半决赛起，赛事将采用两回合制。西亚区半决赛两回合时间为10月19日、26日，东亚区半决赛两回合时间为10月20日、27日。决赛将在11月21日、27日进行。
